一是确立“科技兴院”理念，制订科技发展战略、三年科技创新发展实施纲要、知识产权发展战略、“251”人才培养工程计划。

　　二是成立总院研发中心，建设浦江镇研发基地，围绕行业前沿进行创新研发、试验验证和新产品、新技术攻关；承担了一系列国家和上海中长期科技创新计划相关科研项目，形成了曝气生物滤池、高效沉淀、车流仿真等多项核心技术。

　　三是在重大工程中加强创新，提高工程品质和技术含量。上海长江大桥工程围绕桥梁建养科技攻关，形成公路轨交合建等5项创新技术。

　　四是在工程设计中注重节能减排、可持续发展。自主研发的“双污泥处理系统”技术可为污水处理厂节能30%以上；采用集约化组团式设计白龙港污水处理厂升级改造扩建工程，节省用地20%、工程造价10%。

　　五是制定专利工作管理办法、科技成果转化项目奖励办法，鼓励科研、设计人员申请专利、转化创新成果，目前全院已累积专利200余项。